著有《郑所南先生文集》1卷，《所南翁一百二十图诗集》1卷、《锦钱余笑》1卷。有《知不足斋丛书》本，《四部丛刊》本收有前2卷。明崇祯十一年冬于苏州承天寺井中发现封于铁函内的《心史》1部，题“大宋孤臣郑思肖百拜书”，纪事有与史不合的，或疑为后人假托。存世之画有《国香图卷》、《竹卷》等。
郑思肖论诗主张“灵气”说，认为诗是天地、人心“灵气”的集中表现。郑思肖的诗多以怀念故国为主题，表现了忠于赵宋的坚贞气节，如《寒菊》诗中“宁可枝头抱香死，何曾吹落北风中。”
诗作选
【送友人归】
年高雪满簪，唤渡浙江浔。
花落一杯酒，月明千里心。
凤凰身宇宙，麇鹿性山林。
别后空回首，冥冥烟树深。
【德佑二年岁旦二首】
其一
力不胜于胆，逢人空泪垂。
一心中国梦，万古下泉诗。
日近望犹见，天高问岂知。
朝朝向南拜，愿睹汉旌旗。
其二
有怀长不释，一语一酸辛。
此地暂胡马，终身只宋民。
读书成底事，报国是何人？
耻见干戈里，荒城梅又春！
【题画菊】
花开不并百花丛，独立疏篱趣无穷。
宁可枝头抱香死，何曾吹落北风中。
【伯牙绝弦图】
绝不求人更赏音，只当仰面看山林。
一双闲手无聊赖，满地斜阳是此心。
【咏制置李公芾】
举家自杀尽忠臣，仰面青天哭断云。
听得北人歌里唱，潭州城是铁州城。
【二砺】
愁里高歌梁父吟，犹如金玉戛商音。
十年勾践亡吴计，七日包胥哭楚心。
秋送新鸿哀破国，昼行饥虎啮空林。
胸中有誓深于海，肯使神州竟陆沉？
人物轶事
宋遗民录
所南字忆翁，初名某，宋亡乃改名思肖，即思赵。“忆翁”与“所南”皆寓意也。坐卧不北向，扁其堂曰“本穴世界”，以本之十置下文则大宋也。又著大无工十空经一卷，空字去工而加十，宋也。寓为大宋经。自题其后曰：“臣思肖呕三年血方能书此。”画兰不画土，人询之，则曰：“地为番人夺去，汝不知耶？”题郑子书塾曰：“此世只除君父外，不曾轻受别人恩。”题画菊云：“宁可枝头抱香死，何曾吹堕北风中。”有妹为比邱，号普西。天目本中峰闻公名，偶会于梅应发家，本云：“所南何不说法？”曰：“两眼对两眼，无法可说？”本曰：“博学老子。”公即曰：“世法和尚。”赵子昂数往候之，不得见。疾时属其友唐东屿曰：“思肖死矣，烦公书一位牌曰：‘大宋不忠不孝郑思肖。’”语讫而绝。
贵要者求其兰，尤靳不与。庸人孺子颇契其意者，则反与之。邑宰求之不得，知其有田，因胁以赋役取。先生怒曰：“头可断，兰不可画！”
遂昌杂录
所南自宋亡，矢不与北人交接。于友朋座间，见语音异者，辄引起。人知其孤僻，亦不以为异。隐居吴下，有田数十亩，寄之城南报国寺，以田岁入寺为祠其祖祢。遇讳必大恸寺下，而先生并馆谷于寺。一室萧然，坐必南向。岁时伏腊，望南野哭而再拜。喜佛老教，工画兰，疎花简叶，不求甚工。画成即毁之，不妄与人。
宋稗类钞
所南当宋社既屋，无策自奋，著心史六万余言，铁函重匮，外著“大宋铁函经”五字，内题“大宋孤臣郑思肖再拜书”十字，沈于吴门承天寺眢井。崇祯戊寅冬，寺僧达浚得之。
