嘉庆十六年（辛未）1811年 四十八岁
上巳日，应朱鹤年邀请，与翁方纲等游拈花寺，用《天发神谶碑》体重题“元万柳堂”匾额。四月，《十三经经郛》编成，未刻。六月，撰《汉延熹西岳华山碑考》四卷成。又编《四库未收百种书提要》成。七月，奉旨补授詹事府少詹事。撰《南北书派论》。十二月，奉旨补授内阁学士兼礼部侍郎。上谕云：“尔于刘凤诰事不过失察，尚非有心狥隐。”
是年，作《西岳华山庙碑长垣本摹记跋》，跋云：“四明全碑搨本碑额题名如上式，苏斋所摹未全，大和三年、四年李德裕两至碑下，与新旧唐书《卫公年谱》、《卫公献替记》皆合。海内华山碑三本，商印本最前，故四明本次之，山史本又次之，皆缺百字矣，阮元摹记。（又记）华阴令裴骨直是骨字，并非偏旁半缺也，全碑共二十二行，篆额占地约五行，居中略偏于左，前空十行，后空七行。”
嘉庆十七年（壬申）1812年 四十九岁
五月，补授工部右侍郎，兼管钱法堂事务。八月，补授漕运总督。
嘉庆十八年（癸酉）1813年 五十岁
正月，议设焦山书藏，以《瘗鹤铭》“相此胎禽”等74字编号。作《焦山书藏记》，并书匾额。正月二十日，林则徐过宝应拜见阮元，交陈寿祺信，并长谈。谷雨，为瑾斋作《行书京邸看花诗》。
是年，再题兴教寺唐八角石柱。是年，从宋芝山处购得《齐侯罍》。
是年，以《华山碑》长垣本多出之字，补四明本泐残之缺，以墨线圈出，画成碑图。《汉延熹西岳华山碑考》四卷刊成，江藩为之序。梁章钜谒阮元于淮上，获观《华山碑》四明本。
嘉庆十九年（甲戌）1814年 五十一岁
闰二月，《全唐文》辑成，阮元为总阅官。春三月，钱泳至淮阴谒阮元，得见《南北书派论》。八月，调任江西巡抚。十月，赏加太子少保衔。季冬，嘱朱为弼辨识《齐侯罍》。
嘉庆二十年（乙亥）1815年 五十二岁
二月，刻《宋本十三经注疏》，次年刻成，全书涉及“校”字者，皆作“挍”（缺笔，以避明熹宗朱由校之讳）。
嘉庆二十一年（丙子）1816年 五十三岁
八月十七日，任河南巡抚。十一月十三日，补授湖广总督。
嘉庆二十二年（丁丑）1817年 五十四岁
正月，至汉阳，接任湖广总督。十月，至广州，接任两广总督。十二月，奏建大黄窖、大虎山炮台。春，过当阳县玉泉寺，得见隋铁镬字，并搨之。
是年，赵魏将自己两年前所得江立藏《金石录》让售给阮元，阮元遂以“金石录十卷人家”名书斋，并刻有此收藏印。
嘉庆二十三年（戊寅）1818年 五十五岁
十一月，始修《广东通志》。
是年，作《行书七律诗轴》，洒金笺。——上海博物馆藏。《中国古代书画目录》第三册著录。
嘉庆二十四年（己卯）1819年 五十六岁
三月，作《唐魏栖梧书善才寺碑跋》，行书。
嘉庆二十五年（庚辰）1820年 五十七岁
三月，创办学海堂。手书“学海堂”三字匾悬于城西文澜书院。
道光元年（辛巳）1821年 五十八岁
春，作《摹朱珪篆书十言联》。联为：“学如逆水行舟稍纵即逝，心似平原走马易放难追。”七月，《江苏诗征》刻成。八月初二日，女阮安卒（1802年生，20岁）。
是年，作《黄钺补图王泽小像卷题跋》。
道光二年（壬午）1822年 五十九岁
三月，《广东通志》成。六月，归扬州。
道光三年（癸未）1823年 六十岁
正月，六十寿辰作《竹林茶隐图》。《揅经室集》四十卷刻成。龚自珍撰《阮尚书年谱第一序》。
是年，在广州购得端州巨形砚材，刻成亲王诒晋斋所藏《华山碑》长垣本未缺之字，置扬州公道祠塾，以补四明本之阙。
道光四年（甲申）1824年 六十一岁
九月，以家藏《汉西岳华山庙碑》摹本寄陕西钱恬斋，摹刻于西岳庙中。十二月，新建学海堂成。仿《天发神谶碑》书“学海堂”堂中匾额。《学海堂初集序》书丹刻石，嵌于学海堂壁。——《雷塘庵主弟子记》卷六著录。
道光五年（乙酉）1825年 六十二岁
三月，撰《文韵说》。夏，主辑《皇清经解》（又名《学海堂经解》）。
道光六年（丙戌）1826年 六十三岁
九月，任云贵总督。夏，赴任云南途中，为范素庵医生作《行书五言诗轴》。是年，携《华山庙碑》四明本至云南落水致霉，因雇滇工再装。
是年，在云南陆凉访得《爨龙颜碑》。
是年，作《爨龙颜碑跋》。跋云：“此碑文体书法皆汉晋正传，求之北地亦不可多得，乃云南第一古石，其永宝护之。”
是年前后，为金陵甘氏作《永和右军砖拓本跋》，由滇寄还，否定《兰亭》为王羲之所书的可能性。
道光七年（丁亥）1827年 六十四岁
二月，著《塔性说》。九月十九日，在云南大理见到王昶《金石萃编》所载的《南诏德化碑》，赋诗一首：“文章与书法，确是唐贤派。上溯东爨碑，古法尚不坏。”
道光八年（戊子）1828年 六十五岁
秋，指导其子阮福撰《滇南金石录》成。除夕，于京师寓所再观《华山庙碑》长垣本。
道光九年（己丑）1829年 六十六岁
九月，《皇清经解》在粤东刻成。版藏于学海堂中印刷通行。
是年，作《秋祭东园斋居诗四十韵行书卷》。
道光十二年（壬辰）1832年 六十九岁
九月，升协办大学士，仍留云贵总督任。十二月，孔夫人卒于云南督署。
道光十三年（癸巳）1833年 七十岁
道光赏七十寿辰，御笔书“亮功锡祜”四字匾。三月，充会试副总裁，得士222名。
道光十四年（甲午）1834年 七十一岁
与汤金钊、梁章钜过华山，入西岳庙读碑，并于钱宝甫摹刻《华山碑》题刻。《石画记》四卷撰成。
道光十五年（乙未）1835年 七十二岁
三月，著充体仁阁大学士，管理兵部。
是年，《云南通志稿》修成刊行。
是年，入都，以云南石画《孤山梅石图》赠林则徐，林有谢简。
道光十六年（丙申）1836年 七十三岁
与龚自珍、何绍基、梁章钜等切磋金石文字。充经筵讲官、殿试读卷官，教习庶吉士。五月，为梁章钜所购《西岳华山碑》华阴本题跋于节性斋。夏六月，为梁章钜《退庵随笔》题签、作序。
是年，作《虞集真书刘垓神道碑卷题跋》。
是年，为小亭世兄作《行书轴》，署款“阮元时年七十有三”。
道光十七年（丁酉）1837年 七十四岁
是年，在京师晤吕佺孙，为其作《毗陵吕氏古砖拓本跋》，再次否定《兰亭》为王羲之所书的可能性。
是年，为慎甫四弟作《行草横幅》。高九寸七分，阔二尺九寸六分。
道光十八年（戊戌）1838年 七十五岁
五月，上谕著准阮元以大学士致仕。八月，奏请回籍，晋加太子太保衔。其间，何绍基有《送仪征阮宫太保相国师予告归里叙》为其送行。
十月，归扬州，回大东门福寿庭宅，谨守上谕“怡志林泉”，始署“怡志老人”。
是年，作《隶书七言联》，洒金笺。
是年，作《项圣谟山水册题跋》。
是年，为仲嘉二弟作《珠湖渔隐图题跋》，行书，二十三行。
是年，作《齐侯罍歌卷》，行书。
道光十九年（己亥）1839年 七十六岁
正月，建“南万柳堂”成。五月十九日，与六舟居士游扬州瘦西湖。为六舟居士（达受）藏《唐怀素小草千文》题篆书额及行书跋。六月，龚自珍弃官离京，在扬州与阮元相交甚密。十一月，考跋隋大业当阳县玉泉山寺铁炉字。
是年，书翰页。
是年，作《王学浩山水册题跋》。
是年，《揅经室续集》十一卷成。
是年，在扬州公道桥珠湖草堂之侧，掘出宋菱花铜镜及绍定六年砖。
道光二十年（庚子）1840年 七十七岁
清和月，作《行书七言联》，联为：“铁石梅花清气概，山川香草自风流。”
十月十三日，作《为青藜馆刘恭人五十寿九言联》，联为：“泰华写峰，寿馆双碑色；诗书教子，燕山五桂香。”
是年，作《行书七言联》，钤印：“节性斋老人”、“万柳堂”。
是年，书《清人手札册》。钤印：“怡志林泉”。…
