山本座机的坠落地点位于此前澳大利亚海岸巡逻队在布因岛的据点以北，第二天有一支日军搜救小队找到了这个地点，带队的是日军工兵中尉滨砂。据滨砂中尉回忆，山本的遗体位于飞机残骸之外的一棵树下，仍旧坐在座椅之上，戴着白色手套的双手拄着他的日本刀。滨砂说他当场就认出了山本，海军大将的头微微低下犹如陷入沉思。解剖报告显示山本身上有两处枪伤：一发子弹自身后穿透他的左肩，另一发子弹从他的下颌左后方射入，从右眼上方穿出。即便有此报告为证，关于山本是否从坠落中生还一直都有争议。 为防止日军得知自己的密码已泄露，美国新闻媒体被告知是所罗门群岛当地人的海岸观察站目击到山本登上一式陆攻。新闻媒体也没有公开大部分参与刺杀行动
的美军飞行员的名字，因为其中一人的兄弟当时是日军战俘，有被虐杀的可能。
这次任务成为二次大战中持续时间最长的战斗机拦截任务。在日本，山本阵亡的事件被称为“海军甲事件”。日本当局一直拖到1943年5月21日才公布山本的死讯，朝野震惊。对于被宣传机构蒙骗，以为日军自开战以来不断高歌猛进的日本民众来说，山本之死所造成的精神打击是难以估量的。日本政府也因此被迫承认美军的战争能力正在迅速恢复，甚至开始反击。日本当局追授山本大勋位、功一级、正三位和元帅称号。6月5日，在东京日比谷公园举行百万人参加的国葬。海军还要求追授其男爵称号，但不知为何未获批准。
轶事典故
山本是个冒险家，喜欢在桥边以及悬崖边表演倒立行走。而且他也是个赌徒，他出使欧洲时，进过许多西欧的赌场，传说他由于赢钱太多，被禁止入场。这一点也促使了奇袭珍珠港计划的形成。
获得勋章
大勋位菊花章
旭日桐花大绶章
瑞宝大绶章
功一级金鵄勋章
功二级金鵄勋章
宝剑橡叶骑士铁十字勋章
德意志雄鹰勋章
精彩评析
山本在其海军生涯的绝大部分时间是在海军军政部门度过的，应该说山本五十六是一个出色的军政官僚而既不是一个海军领导人也不是一个舰队司令。日本海军内部说，联合舰队司令山本和海相岛田繁太郎完全安错了位置，他们两个换一个身份才是最合理的。作为海军领导人，山本五十六是知道和美国作战的后果的，实际上山本十分反对日本加入轴心国和美国开战，因为在早期的留学生涯山本对美国的实力十分清楚；作为舰队司令，山本五十六在1940年首相近卫文麿问起开战前景的时候居然说出：“一年半年没有问题，两年三年就没有把握了，三国条约已经签了，谁也没有办法”说明山本对形势十分清晰，他本人极力反对和美国开战，但是迫于陆军部掌权的压力，不得不谋划偷袭珍珠港，将日本带入了战争的深渊。
山本的赌注是出奇制胜，提出航空战的理念在当时是十分超前的，山本除了在1928年临时担任过四个月轻型巡洋舰“五十铃”的舰长和在1928年底出任航空母舰赤城号舰长之外。山本和航空有很大的关系，1924年出任霞浦航空队副队长，1930年出任海军航空本部技术部少将部长，1935年出任海军航空本部中将本部长。从根本上来说，山本五十六属于航空论的提出者，也是航空论作战的奉行者。山本五十六选择飞机作为一种新的作战模式。在其平生的珍珠港和中途岛两大赌注中，先赢后输，后者本质输在谍报上，日本的电文密码被破译，最后也导致了山本乘机巡视的时候被袭。
和南云忠一一样，山本也是个悲剧性人物。从来没有当过舰队司令，只有过一年的舰长经验的山本五十六，长期从事军政工作，根本没有从事过军令工作。当初来当联合舰队司令就是一种临时的措施，因为主战的右翼们扬言要暗杀反对三国同盟的山本海军次官。问题是谁都想不到山本居然制定出大胆的珍珠港作战计划出来，更大的问题是这个疯狂的计划居然还严重成功。
实际对认为山本五十六没有战略眼光是最大的诋毁，就在珍珠港偷袭前夕，山本还寄希望于外交部从美国那得到的答复，内心来说山本五十六是不想和美国开战的。
山本本人是舰队派，但不意味着他对条约派将领就恨之入骨。长期在军政领域混的山本在用人有独到之处，虽然不是政治家，但很有政治手腕。在山本看来，条约派，舰队派，航空主兵派，大舰巨炮派都是日本军人，争论的只是技术问题，没有必要上纲上线，弄得你死我活，所以在山本手下各类人才的人汇集一堂。舰队派的主力南云忠一，大舰巨炮派的福留繁当然不要说了，航空主兵派的大西泷治郎也能得到用武之地，最后升到军令部次长。要知道没有海大学历的大西泷治郎如果在陆军的话是连参谋本部的大门都进不去的。这种做法，充分说明山本用人不是单看资历，而是结合了个人的特长。
山本经常无视军令部的作战计划，在一些作战中表现的十分果敢。在偷袭珍珠港和中途岛海战等战役中，表现其喜欢用奇致胜的性格。
至于山本五十六等人反对同美国开战的原因，绝不是“爱好和平”，而是觉得没有胜算（招惹美国对于日本来说无疑会树立强大的敌人，使得日本的侵略扩张政策半途而废）。战前他曾预测说：“如果在开战后的一年之内，还满可以干一阵子，以后如何，很难预料。”言下之意是反对开战。当对英美开战已成定局时，他立即制定了偷袭珍珠港的计划，由此可见，山本反对对美开战完全不是出于和平的考虑，而是从开战日本极可能战败这一点出发的。
人物往事
山本五十六一生之中给他的女人们写过无数的情书。在所有的情书当中，感情最为真挚的是他给河合千代子的那些书信。河合千代子和堀悌吉是山本五十六最信赖的两个人。在给她们的书信中，山本经常把自己内心中不愿或者不能对他人讲的一些想法、秘密及苦闷毫无保留地写给她们。
给千代子的情书
山本五十六是1933年夏天认识河合千代子的，到第二年夏天两人的关系才有所发展。在山本出使伦敦参加裁军会议前夕，两人已经打得火热了。下面这封情书便是山本五十六于1935年春天写给河合千代子的：回忆这如同在梦境中度过的三四年，我因同你结识，得到你的温暖和理解，而感到幸福。我把你视为我的妹妹、知音，当然也是情人。你身体的瘦弱，时时使我深感不安。 每当我想起你娇艳多姿的身影，就无法抑制内心对你的眷恋之情。虽然我们就要分离了，但我们之间迅速发展起来的炽烈的感情之火，还是使我无比的兴奋，热血沸腾。对你爱恋的烈火在不断地燃烧着我的整个身心。我恨不能插上翅膀飞入你怀抱，为你减轻孤独寂寞之苦。但有时我又分明地感到，我作为一个须眉男子，在你面前表现得那样脆弱与温柔，未免有些难为情。以上肺腑之言，我只能直言于你，千万不能泄露于他人。”
为正子学卓别林走路
1940年年末，晋升为海军大将的山本五十六，成为日本联合舰队的司令长官。他的情人40岁的正子经营着一家名为“东乡”的小酒馆，为了能够见到山本，她特地从佐世保赶往别府港。 山本对正子的到来感到意外，但他十分感激正子对自己的一片痴情。尽管当时的山本五十六正在为偷袭珍珠港而绞尽脑汁，他仍然抽出时间陪伴正子。 有一天，山本和正子从一家烤鳗鱼店吃过晚饭出来，山本突然焕发了青春的活力，他叉开双脚呈外“八”字形，弓腿弯腰，在正子面前学起了电影上卓别林的走路姿势。当时恰巧有几名海军的士兵经过此地，其中一个水兵小声地对另外几个说：“喂，看，那不是咱们的司令长官吗？！” 几个水兵瞪大了眼睛看着山本，其中一个不敢相信自己的眼睛：“别胡说了，那怎么可能是山本长官呢？咱们的司令可不会在大街上那样出洋相吧？”
被美机伏击的背后
山本为什么要去前线呢？
草鹿任一是海兵37期的，和小泽治三郎同期，但吊床号是21号，比小泽高出了20几号，因此在配合作战时，草鹿中将就是先任长官，小泽得听草鹿的。…
