陈丹青不认同现行考试制度，不认同教学大纲，不认同排课方式，不认同艺术学生的品质以“课时”与“学分”算计。他认为人文艺术教育不应该以英语和政治考试分数作为首要取舍标准。他也不能适应“学术行政化”的体制：“在我奉命填写的所有表格中，完全无法体现我的教学思想与教学结果”。于是，他“不想再玩下去了”，遂递交辞呈：“当我对体制背后的国情渐有更深的认知，最妥善的办法，乃以主动退出为宜。我之请辞，非关待遇问题，亦非人事相处的困扰，而是至今不能认同现行人文艺术教育体制。”2004年末，陈丹青愤然辞职，随即引发了一场关于现行教育体制的厉声讨伐。
陈丹青作为一个大学教授，在与现行制度不相适应时，他没有选择委曲求全，他一如既往地坚持了自己——真实，为此不惜公然站出来充当反对体制的先行者。
