1992年11月，城东、大济、龙华、赖店、盖尾、游洋、钟山等7个乡改为镇。全县共有12个镇，辖17个居民委员会，233个村民委员会，3971个村（居）民小组；7个乡，辖71个村民委员会，851个村民小组。
2000年，仙游县辖13个镇、6个乡：鲤城镇、榜头镇、枫亭镇、郊尾镇、度尾镇、城东镇、大济镇、龙华镇、赖店镇、盖尾镇、钟山镇、游洋镇、园庄镇、西苑乡、凤山乡、石苍乡、社硎乡、书峰乡、象溪乡。
2002年9月，福建省人民政府（闽政文270号）批复同意仙游县调整部分行政区划：
2002年底，仙游县辖1街道12镇5乡。
2003年，仙游县辖1个街道、12个镇、5个乡：鲤城大街道、鲤南镇、榜头镇、枫亭镇、郊尾镇、度尾镇、大济镇、龙华镇、赖店镇、盖尾镇、钟山镇、游洋镇、园庄镇、西苑乡、石苍乡、社硎乡、书峰乡、象溪乡。
2008年12月31日，福建省政府《关于同意仙游县象溪乡更名为菜溪乡的批复》（闽政文448号）：经研究，同意仙游县象溪乡更名为仙游县菜溪乡。
现行区划
2014年，仙游县人民政府驻鲤城街道，全县辖1个街道、12个镇、5个乡：鲤城街道、枫亭镇、榜头镇、郊尾镇、度尾镇、鲤南镇、赖店镇、盖尾镇、园庄镇、大济镇、龙华镇、钟山镇、游洋镇、西苑乡、石苍乡、社硎乡、书峰乡、菜溪乡。
地理环境
位置境域
仙游县地处福建省东南沿海中部，位于东经118°27'—118°56'，北纬25°11'—25°43'之间，县域东西宽49公里，南北长63.4公里，濒临湄洲湾、紧挨秀屿港，距省会福州130公里，距经济特区厦门153公里，距莆田市区44公里，与宝岛台湾隔海相望。县域总面积1835平方公里，占莆田市的44%。
地势地貌
仙游县地处戴云山脉东坡，地势总体自西北向东南倾斜，地貌主体成向东南开口的马蹄形。境内以丘陵为主，盆地、河谷错杂其间。各地海拔差别很大，西北边境的石谷解海拔1803.3米，是全县最高峰，东南部枫亭海滨海拔仅5米，是全县最低点。境内分成四个不同的地貌地带。
自然气候
仙游县气温1月份最低，7月份最高，上半年气温逐月上升，下半年气温逐月下降。各地年平均气温在15.0--21.0℃之间，木兰溪沿岸平原和东南部沿海略高于20.0℃，北部和西北部山区低于18℃，境内气温年自东南向西北随着地势、海拔的升高而递减，变化明显。气温日变化以日出前（5--6时）最低，午后（13--14时）最高。仙游县气温日较差平均8.9℃，12月最大为9.8℃，6月最小为7.6℃。全县各地无霜期在233--341天，长短差达108天。年平均霜期52.4天，最多90天，最少1天。历年平均太阳辐射量为4622.6兆焦耳/平方米。
自然资源
矿产资源
仙游县有铬、铌、钽、铅锌、钨、铝、铁、锰、金沙、黄铁矿等，但储量较少，且多为品位低的小矿点，开采难度较大。其中铁和锰储量较多。
动物资源
仙游县野生动植物资源比较稳定。宋宝佑《仙溪志》记有植物71种，动物23种；明弘治《兴化府志》记有植物301种，动物234种；清乾隆《仙游县志》记有植物284种，动物82种。
仙游县现存的陆栖野生动物有两栖类、爬行类、鸟类、哺乳类等脊椎和无脊动物共计1200多种，淡水鱼类有65种，海洋鱼类多数是沿海岸性次级经济鱼类。
主要有软体、节肢及拟软体等无脊椎动物数百种。其中已鉴定的172种是：蟹、贝、藻等水生动物中，有软体动物88种，节肢动物33种，拟软体、环节动物13种。可供养殖且有经济价值的有青蟹、鲟、牡蛎、缢蛏、花蛤、泥蚶、扇贝等38种。
现属国家保护的珍贵野生动物有：属国家二级保护的有穿山甲、猕猴、水獭、鸳鸯等；属国家三级保护的有大灵猫、小灵猫、豹猫、青羊等。凤山的角怪属世界珍稀动物。
植物资源
仙游县南部属闽东南戴云山东湿暖亚热带雨林小区，北部属闽中东戴云山--鹫峰常绿槠类照叶林小区。由于仙游县地处南亚热带和中亚热带的交界处，境内地形复杂，北部为海拔500--1800米的中、低山区，南部大部在海拔500米以下的丘陵台地，气候、土壤、水流等自然条件明显差异，因而植物区和植被类型具有过渡性的特点，原生植被残存很少。而代之以次生阔叶林、针叶林和针阔混交林等。
据仙游县自然资源调查，仙游县主要植被有6个类型：
宋宝佑《仙溪志》记有植物71种；明弘治《兴化府志》记有植物301种；清乾隆《仙游县志》记有植物284种。
全县植物品种总计有171科，共2876种。其中，藻菌类11科，43属，计划性92种苔藓类4科，5属，计28种；蕨类15科，23属，125种；裸子植物类7科，8属，计81种；孢子植物134科，250属，计2350种。列为国际性国家级保护的珍贵植物有26种。其中，属国家一级保护的有水杉；属国家二级保护的有银杏（分布社硎、菜溪等地）、水松（分布仙游山、麦斜、五湖等地）、福建柏、胡桃、格木、杜仲、金钱松、楠木、铁刀木、云南石梓、红豆杉、山腊梅、青梅、巴戟、荔枝、小勾儿茶、异形玉叶金花等17种；属国家三级保护的有油杉（分布梧椿、潭边等地）、天竺桂、木荚红豆树、黄杞、厚朴、闹阳花、龙眼等8种。
水电资源
仙游县溪流蜿蜒曲折、短小、湍急，落差大，易涨易退，属山地性溪流。历史上，境内通航小木船，从会仙（鲤城）至俞潭（今盖尾仙潭），水程30公里。水力资源蕴藏量为26万千瓦，可供开发利用的有200多处，全部开发利用后，装机容量可达17.43万千瓦，年发电量可达6.52亿千瓦时。绝大多数溪流发源于境内，合流或分流出境，分属木兰溪、大樟溪、枫慈溪、晋江东溪、沧溪等五条溪，其中，主要属木兰溪水系。
仙游县地表水资源总量约18.55亿立方米，平均每平方公里集雨面积产水量101.85万立方米，人均水量2027.8立方米，亩均水量5260.9万立方米，低于中国、福建省平均水平。
地表水资源在空间分布上的总体情况由北部山区向东南部递减。每平方公里集雨面积产水量，以北部凤山、西苑、社硎、象溪、石苍、游洋、钟山等最多，南部盖尾、郊尾、枫亭、园庄等最少，中部大济、城关、龙华、赖店、榜头等略少。人均与亩均水资源，以凤山、西苑最多，榜头、郊尾最少。
仙游县水力资源主要分布在木兰溪、延寿溪、九溪、粗溪等溪流，流域面积在1000平方公里的1条，100平方公里以上的有5条，流域雨量充沛，溪床坡降较大，水流湍急，利于发电。据勘测，全县水能理论蕴藏量为26万千瓦，其中木兰溪11.72万千瓦，延寿溪1.08千瓦，九溪7.1万千瓦，粗溪3.9万千瓦，枫慈溪0.8万千瓦。可供开发的水力发电站近200处，总装机容量17.43万千瓦，其中木兰溪7.81万千瓦，延寿溪0.65万千瓦，九溪5.61万千瓦，粗溪2.58万千 瓦，枫慈溪0.1万千瓦，其他溪流0.669万千瓦。
人口
总量
在4000年前的新石器时代晚期，仙游土地上就有人类居住，园庄乡土楼村溪尾山留有先民活动的遗址、遗物。先民们以磨制的石器、上釉的陶器作为日常生活、生产用具，从事农耕渔猎以及手工纺织业、制陶业等。
据宋《仙溪志》载，唐圣历二年（公元699年）建县时，仙游人烟稀疏。五代十国时，北方人民避乱南迁，其时主客未满千户。北宋末年，北方人民再次避乱南迁，大批入境。明代，人口趋于下降，在其后的150余年间，徘徊在1--1.5万口之间。到清代，经历了“乾嘉盛世”之后，人口增加，同时人口统计由仅计成丁口数改为男女老少均计在内，故人口统计数骤增，至宣统三年（公元1911年）全县人口达49320户共计306798人。 …
