检察机构与四级法院相对应，分为最高检察厅、高等检察厅、地方检察厅、区（镇）检察厅。检察官分为检事总长（总检察长）、次长检事、检事长（高等检察厅长）、检事（地方检察厅长称检事正）、副检事等。检事长以上官员由内阁任命。法务大臣对检事总长有指挥权。
军事
帝国军
帝国军，第二次世界大战之前日本的军队，即天皇统领下的军队；日本侵略中国期间中国称之为“日寇”。通常指大日本帝国的军队（即日语中的“大日本帝国陆军、大日本帝国海军”），日军曾自称“皇军”（现有皇军、国军、皇御军、帝国军、帝国陆海军、大日本军等称呼）。
帝国军组建于1867年，解散于1945年；最高统帅为日本天皇，由日本陆军参谋本部、海军军令部直接指挥。
日本1945年战败投降后，军队被解散，军事机构被撤消。1950年朝鲜战争爆发后，美国基于其自身需要，指令日本重新发展军事力量。同年，日本组建“警察预备队”，后改称保安队，1952年成立“海上警备队”，1954年新建航空自卫队，7月颁布《防卫厅设置法》和《自卫队法》，将保安队、海上警备队分别改称为陆上自卫队和海上自卫队，将陆、海、空三军正式定名为自卫队，并成立了防卫厅和参谋长联席会议，健全了统帅指挥机构。
随着《防卫厅设置法》的修改，防卫厅在2007年1月9日升格为防卫省，成为日本中央一级单位。防卫厅升格为防卫省后，日本首相仍为自卫队的最高指挥官。然而，防卫大臣将从此负责日本全国的国防事务，未来不需要再经过内阁，即可自行向国会两院提出与国防相关的法案及预算案。另外，原本定义为“附属任务”的国际紧急救援协助事务、联合国维和事务以及根据《周边事态法》的后方支援等事宜，亦将视为“正常任务”，不用再以个案的方式经国会两院审议通过。7月4日久间章生因发表“美国向日本投掷原子弹是无奈之举”的言论而辞职，由小池百合子接替其出任防卫大臣，成为日本历史上首名负责防卫事务的女性内阁成员。
截止2006年3月，日本总兵力编制员额33万人，其中现役军人25.2万人，文职2.4万人，预备役5.6万人。其中陆上自卫队约14.8万人，编为5个方面队，辖13个师和2个混成旅、1个空降旅，装备坦克1020辆，装甲车约980辆，各型飞机约511架，各种火炮7630门；海上自卫队约4.4万人，由担负机动作战的联合舰队和负责近海警备的5个地方队组成，装备各型舰艇142艘，39.8万余吨，飞机206架；航空自卫队约有4.5万人，主要作战部队为航空总队，辖3个航空方面队和1个航空混成团，装备各型飞机464余架，其中作战飞机361架。此外还拥有各式导弹28种。防卫厅机关和直属机构编制7000余人。
自卫队
自卫队（Japan Self-Defence Forces，JSDF）是第二次世界大战之后的日本国家军事武装力量。正式组建于1954年7月1日，根据日本《和平宪法》第九条规定：日本的军事实力只能维持在自卫所需的水平。日本自卫队属民兵编制，不是正规军，因此日本是一个名义上没有军队的国家。
日本自卫队是由首相领导，而管理则由防卫省负责。日本自卫队现存总兵力大约为23万，由防卫省所统筹管辖。1951年，日本在朝鲜战争中对北朝鲜宣战并派出了扫雷部队参加朝鲜战争，这是二战后日本的首次向国外派兵，同时也是二战后日本唯一的一次对外国宣战。
日本国内亦有要求因应周边局势（北朝鲜核武威胁、提防中国崛起），修改《和平宪法》第九条的呼声，以及将自卫队“升格”成“自卫军”。2004年，小泉纯一郎内阁曾发起是否修改《和平宪法》第九条的全民公决，最终被日本民众否决。
编制定员16.7383万人，实有兵员14.5928万人。编成5个军区、11个步兵师、1个装甲师、1个步兵旅、2个混成旅、1个空降旅、1个炮兵旅、5个工兵旅、8个防空导弹群。截至1999年3月底，共装备坦克1090辆（90型、74型），装甲车710辆，自行火炮640辆，各型火炮6240门，各型飞机502架。
陆上自卫队参谋部驻东京都。
编制定员4.5812万人，实有兵员4.3838万人。编有1个联合舰队，下辖1个护卫舰队、1个航空集团、1个潜艇舰队，另有5个地方队。截至1999年9月底，共装备各型作战舰艇140艘，总吨位约35.8万吨，其中驱逐舰、护卫舰53艘18.3万吨，潜艇16艘3.9万吨，扫布雷舰艇32艘2.7万吨；各型飞机215架。
海上自卫队参谋部驻东京都。补给本部和中央通信队群驻东京都。
编制定员4.7266万人，实有兵员4.5223万人。编有1个航空总队，下辖3个航空方面队（各辖两个战斗航空团）、1个航空混成团、6个防空导弹群；1个航空支援集团；1个航空教育集团（下辖2个训练航空团、3个飞行教育团）；1个航空开发实验集团。截至1999年3月底，共装备各型作战飞机498架，其中歼击机358架、侦察机26架、预警机7架、运输机59架。
航空自卫队参谋部驻东京都。
航空总队、航空支援集团司令部设在府中市。航空教育集团、航空开发实验集团司令部分别设在浜松市和狭山市。补给本部设在东京都。
美国驻军
美国在日本的驻军约3.91万人，其中陆军约1800人、海军约6700人、海军陆战队约1.66万人、空军约1.4万人。美军驻日基地建立于二战时日本战败后。
旧时军衔
旧日本陆军军衔分为将官、佐官、尉官、准士官、下士官和兵，计6等16级。佐官相当于校官，准士官相当于准尉，下士官相当于军士。按照日本的称谓，16级次序为：大将（日军称上将为大将）、中将、少将、大佐（上校）、中佐（中校）、少佐（少校）、大尉（日军称上尉为大尉）、中尉、少尉、准尉、曹长（上士）、军曹（中士）、伍长（下士）、上等兵、一等兵、二等兵。
战败
1945年8月21日，日本投降代表八人下机乘坐插有白旗的降车驶往指定地点。
外交
日本外交政策的基本取向是坚持以日美同盟为基轴，以亚洲为战略依托，重视发展大国关系。重视加强日美安全合作，同时致力于稳定对韩关系，深化与东盟关系，加强对欧关系，改善日俄和日朝关系。积极参与地区和国际政治、经济和安全事务，力争成为联合国安理会常任理事国。
中日关系
1972年9月29日，中日两国签署《中日联合声明》，实现邦交正常化，并放弃了日本侵华战争的国家赔偿，1973年1月互设大使馆。
1995年8月，时任日本首相村山富市发表讲话，承认日本过去实行了错误的国策，走了战争道路。他表示，要深刻反省历史、吸取历史教训，“必须把战争的悲惨告诉年青一代，以便不再重犯过去的错误”。
2012年9月11日，日本政府宣布所谓的“钓鱼岛”国有化，中国大陆、香港、台湾以及海外爱国人士纷纷举行游行抗议，此次游行成为新世纪以来，反日游行规模最大的一次，仅在大陆就超过180个城市参加。
2012年12月26日，新任内阁官房长官菅义伟在东京表示，日本新一届政府将继承“村山谈话”。
2014年11月8号APEC部长级会议召开之前，王毅部长表示，中方重视日方多次提出的愿望，我们在中日关系上的原则立场是明确和一贯的。昨天，中日双方就如何处理当前影响两国关系的主要问题发表了四点原则共识，希望日方认真对待、切实遵循、落到实处，从而为两国领导人见面营造必要和良好的氛围。
2015年3月9日
，德国总理默克尔抵达东京，开启对日本为期两天的访问。她委婉地告诉日本要直面历史，默克尔表示，尽管德国是二战爆发和大屠杀的责任方，但由于德国没有回避历史，因此获得了国际社会的谅解，并于1945年之后采取了和解态度。她也提到二战后德国和法国达成和解，是时代的一大成就之一：“如果没有我们的邻居的大度姿态，这（和解）无法达成。但更重要的是，德国有着实事求是面对历史的意愿。” …
