樊世被杀，在氐族蒙强中引起轩然大波。他们又纷纷到苻坚面前诋毁王猛。苻坚非常生气，除责骂外，还举起鞭子把他们揍了一顿，这才平息了这场风波。但仍有一些氐族显贵，自恃皇亲国戚，恣意妄为，特世强德就是其中的一个。他依仗自己是皇太后（苻健皇后）的弟弟，酗酒行凶，欺男霸女，胡作非为。王猛早有所闻，一天又见他在大街上胡闹。王猛当即决定逮捕强德，斩首示众，陈尸街头。随后又和御史中丞邓羌通力合作，全面查处扰民乱政的权贵，接连诛杀了二十多个不法的贵戚豪强。于是，京城内外百官震肃，豪强贵戚无不老实守法。社会风气大为好转，出现了路不拾遗，夜不闭户的良好秩序，老百姓拍手相庆。苻坚看在眼里，喜在心头。他深有感触地说：“现在我才知道天下有法制的好处。”
富国强兵
随着吏治的整顿，恣意妄为，贪污受贿等腐败现象日趋消除，社会风气和社会治安大为好转。苻坚又开始了礼治建设，也就是设立学校办教育，提高民众的文化素质，培养治国人才。他自幼学习汉族文化，仰慕儒家经典，为扭转氐族迷信武力，轻视文化知识的落后观念，积极恢复了太学和地方各级学校，广修学宫，招聘满腹经纶的学者执教，并强制公卿以下的子孙入学读书。苻坚每月到太学一次，考问诸生经义，品评优劣，勉励他们刻苦学习。
苻坚还亲自挑选品学兼优的学生，让他们到各级权力机构任职。同时规定：俸禄百石以上的官吏，必须“学通一经，才成一艺”。如果不通一经一艺，则一律罢官为民。由于苻坚的大力倡导，并同官吏的选任结合，前秦很快就出现了劝业竞学、养廉知耻的风气。不仅培养了官僚后备队伍，提高了统治阶层的文化素质，同时也促进了民族间的文化交流。
苻坚即位后，前秦的经济形势也极其困难。由于战乱不息，天灾连年，出现了国库空竭，民生凋敝。为了迅速扭转百废待兴的萧条局面，苻坚决定偃甲息兵，大力发展生产。
公元358年，前秦广大地区遭到大旱，为了同老百姓一起渡过难关。苻坚下令减少自己的膳食，撤销歌乐，后宫皇妃以下的宫女改换布衣。不再穿绫罗绸缎。文武百官也相应地减少俸禄，以示与民共休戚。同时还指令开发山上的矿产林木，解除限制河流湖泊渔业的禁令，使国家和老百姓共同分享。停止一切军事行动，使人民获得休养生息。由于苻坚的措施得力，虽然遭遇大旱，却没有引起大的饥荒灾难。
为了解决关中地区少雨易旱的问题，苻坚下令官府证调了豪富童仆三万人，开发迳水上游，凿山起堤，疏通沟渠，灌溉梯田和盐碱地，使荒芜了多年的田地又重新长出了五谷，老百姓深受其利。苻坚还亲自耕作，他的夫人苟皇后也到近郊养蚕，以劝勉农民积极从事农业生产和丝织。苻坚又多次派遣使臣到各地巡视，抚恤孤寡老人。劝课农桑，推广先进的生产技术，奖励努力种田的农民。后来，前秦再次遭遇大旱灾，苻坚考虑到农民歉收，就下令减免部分租税，节约官府开支，适当降低官俸，并规定不是当务之急就不要征派徭役了。 由于苻坚把发展农业作为基本的国策，前秦的经济恢复很快，几年后便出现了安定清平、家给人足的新气象。史载，从长安到各州都，都修了通道驿亭，游人和商贩沿途取给十分方便。老百姓有歌谣说：“长安大街，杨槐葱茏；下驰华车，上栖鸾凤；英才云集，诲我百姓。”
五公之乱
公元364年（甘露六年），汝南公苻腾谋反被杀，当时王猛以苻生诸弟尚有五人 ，建议苻坚除去五人，否则终会为患，然而苻坚不听。至次年，因着刘卫辰及曹毂的叛乱，苻坚亲自率军出征平定，并北巡朔方以抚诸胡。时为征北将军的苻幼趁机领兵进攻当时由太子苻宏、王猛及李威留守的首都长安，只因李威领兵击斩苻幼而平定乱事。
苻幼起事时其实还暗中联结了征东大将军、并州牧、晋公苻柳以及征西大将军、秦州刺史、赵公苻双，但苻坚以二人分别为伯父苻健爱子及已之同母弟而不问罪，亦不将此事公布。然而，二人却与时为镇东将军、洛州刺史的魏公苻廋及安西将军、雍州刺史的燕公苻武共谋作乱。苻坚得知，于是召四人到长安，但四人就在公元367年（建元三年）十月各据州治起兵反叛，苻坚试图劝其罢兵，答应一切如故，不作追究，并以啮梨为信物 ，但四人都没有任何动摇。次年正月，苻坚正式遣军平叛，派杨世成、毛嵩、邓羌、王猛、张蚝等人分途出兵，分别进攻四地。但当时杨世成及毛嵩都分别败于苻双和苻武的叛军，逼使苻坚再将王鉴、吕光等人率兵再攻。最终王鉴、吕光及王猛等先后击败并斩杀四公，才令乱事成功于当年平定。而在苻坚进攻苻廋时，苻廋主动献州治陕城（今河南陕县）归降前燕，并请兵接应。此举震动前秦，更逼使苻坚派大军至华阴（今陕西华阴）防备，只因前燕太傅慕容评拒绝迎降，才避免了更大的危机。
统一北方
公元369年（建元五年），前燕吴王慕容垂在击退东晋桓温的北伐军后因受到慕容评排挤，于是出奔降秦。苻坚早于两年前知道慕容恪去世的消息时就已经有吞并前燕的计划，还特地派了使者出使前燕以探虚实，然而苻坚因为慕容垂的威名而不敢出兵。 现在慕容垂自来，苻坚十分高兴，并亲自出郊迎接，对其极为礼待，更以其为冠军将军，不顾王猛要他提防慕容垂的谏言。
同年十二月，苻坚以前燕违背当日请兵的诺言，不割让虎牢（今河南荥阳汜水县西北）以西土地予前秦为借口出兵前燕，以王猛、梁成和邓羌率军，进攻洛阳（今河南洛阳市），并于次年年初攻下。六月，苻坚再命王猛等出兵前燕，自己更亲自送行。王猛终在潞川击溃率领三十多万大军的前燕太傅慕容评，并乘胜直取前燕首都邺城（今河北临漳县西南），苻坚更在王猛围攻邺城时亲自率军前往邺城助战。拿下邺城后，正出奔辽东的前燕皇帝慕容暐被前秦追兵生擒，前燕在辽东的残余反抗力量亦遭消灭，前秦正式吞并前燕。
另一方面，公元369年（建元五年），东晋将领袁真在桓温北伐失败后因被桓温委以战争失利的罪责，愤而据寿春（今安徽寿县）叛变，联结前燕及前秦。 袁真不久去世，但其子袁瑾仍然坚守寿春，并在前燕亡后继续向苻坚求救。苻坚于是于公元371年派王鉴及张蚝救援，但围城的桓温派将领桓伊等击败王鉴等，逼其退屯慎城（今安徽颖上县），不久寿春被晋军攻陷。
在前秦吞并前燕，收抚前燕领土的同一年，名义上臣服于前秦的仇池公杨世死，其子杨纂袭位后只受东晋朝命，断绝与前秦的臣属关系，苻坚遂在次年（371年）派兵进攻仇池。当时杨纂叔父杨统正与杨纂兵戎相见，东晋梁州刺史杨亮知道前秦进攻后亦派了郭宝等领兵协助杨纂，然而最终杨纂军大败，在仇池兵临城下及杨统率众降秦之下，杨纂只得出降。此后前秦命参与进攻仇池的将领杨安镇守仇池。前仇池至此灭亡。当时苻坚有意在河西树立威信，以德怀民，于是尽释早前俘获的前凉将领阴据及其所统五千兵士，前凉君主张天锡在佑道前仇池被前秦攻灭后甚为畏惧，至此就被逼向前秦称藩。吐谷浑君主碎奚亦因前仇池灭亡而遗使向前秦进贡，苻坚亦授予其官职爵位。另外，苻坚又出兵攻伐陇西鲜卑首领乞伏司繁，尽降其众，苻坚留乞伏司繁在长安，只由其堂叔乞伏吐雷统众。
公元373年（建元九年），东晋梁州刺史杨亮派其子杨广进攻仇池。但杨广败于仇池守将杨安，原先驻守沮水防备前秦的各军戍更因而弃守溃逃，逼使杨亮退守磬险。而杨安亦趁机进攻东晋，进攻汉川。不久，苻坚更命益州刺史王统领攻汉川，毛当等攻剑门（今四川剑阁东北），大举进攻东晋梁、益二州。杨亮在青谷率巴獠抵抗但失败，只得退保西城（今陕西安康西北），结果汉中（今陕西汉中）、剑阁（今四川剑阁）、梓潼（今四川梓潼县）等地先后失陷。东晋益州刺史周仲孙在绵竹（今四川绵竹县）要抵抗来侵的朱肜部时，另一边的毛当已经快攻到益州治所成都（今四川成都），周仲孙唯有逃到南中，于是前秦攻下了益、梁二州。…
