默娘成为海神后，更加勤恳为民造福，她先后收伏高里鬼、晏公、甚至还有外国的莫尔斯等海妖、鬼怪，教化他们改恶从善，将来成为她水阙仙班的成员，协助她保障海上平安。在妈祖的感召下，这些恶神们大有改观，逐渐洗心革面，成为妈祖的臂膀。此时才知道，汪小凡乃是水怪晏公所化，杀死汪小凡所化，他偕妙珠带孩子去监狱探望汪施旗，并认汪为父亲，汪在一番忏悔后死在狱中。
妈祖成为海神后，与吴宗伦联系频繁，人间仙境相互携手，为民造福。时遇家乡一带大旱成灾，妈祖亲自向雨神求雨，没想到，雨神一向自以为是惯了，居然戏弄妈祖，承诺时刻并不降雨。妈祖靠自己的智慧，在玉帝面前力陈，逼迫雨神为家乡解了干旱之苦，又改匪岛为开垦区，安置外乡流入灾民，并亲种蔬菜以解灾民燃眉之急，留下了菜子屿的名称和一段佳话。
妈祖屡派部下深入无名岛，摸清睚眦一伙建行宫的阴谋，并靠王母的留音石取得证据。睚眦一伙到底侦知了狴犴出家为僧的行踪，为斩草除根，他率领部下追杀同胞兄弟，妈祖再次赶到，危急中救下了狴犴。狴犴表示不再回龙宫，他要追随妈祖做一番事业。睚眦为防无名岛工程泄密，唆使力大无穷的六弟将台湾岛背到远离大陆之处，吴宗伦和妈祖合力打造了天钉，把宝岛牢牢拴住。敌军被吴宗伦大军逼退到顺风岛上，借火炮反击，使我军陷入劣势。关键时刻，妈祖出现在敌军阵前，以大仁大德之辞斥退敌将军，率兵退出侵占我国岛屿，而吴宗伦在抗击入侵敌兵时，奋勇杀敌，最后中敌箭壮烈牺牲。
睚眦在无名岛行宫竣工之夜，指使部下将民夫全部沉海，事情泄露后，又指使帮凶在海面沉船，民夫纷纷落水，妈祖一方面率众搭救，同时回到娘家，说服父亲与嫂子，把房屋点燃，以灯塔的作用给落水的难民指引方向。林家的大义之举感动了乡亲们，大家纷纷出力，帮助林家重建家园。
妈祖将睚眦侵等人的罪行向玉帝禀报，让恶人受到了应有的惩罚。在人证物证面前，睚眦一伙均无可抵赖，受到了天律的严惩。妈祖的水阙仙班得以顺利组建，她继续带领部属们，巡逻在辽阔的海面上。
吴宗伦被封为抗敌英雄，妈祖也屡朝受封，她的事迹传遍世界。
