“九三学社”是中国民主党派重要的一支，成立于1945年9月3日。它的产生与发展，与南京大学的前身——中央大学有着密不可分的渊源关系。
1939年春，中央大学内迁重庆，潘菽、梁希、金善宝等知名教授发起组织“自然科学座谈会”，1944年底定名为“民主科学座谈会”，成为有组织、有目的的政治性学术团体。1945年9月2日，日本在投降书上正式签字。民主科学座谈会在1945年9月3日举行庆祝大会，会议决定民主科学座谈会更名为“九三座谈会”。
1945年8月28日，毛泽东、周恩来、王若飞等中共代表团成员飞抵重庆，与国民党共商国事。谈判期间，毛泽东、周恩来会见了重庆8位进步教授，其中中央大学的梁希、潘菽、熊子容在坐，会见时毛主席明确建议：九三座谈会应办成永久性的组织。后九三座谈会更名为“九三学社”。在成立大会上，九三学社发表了国是主张，选举产生了九三学社首届理事和监事。中央大学潘菽、梁希分别担当九三学社常务理事和常务监事。
中央大学的九三学社成员，在历次斗争中与全校师生携手合作，并肩战斗，不论是反饥饿、反内战、反迫害的“五·二○”运动，还是“四·一”大惨案，以及在反对学校南迁、应变护校、迎接南京解放的斗争中，九三成员都作出不可磨灭的贡献。
新中国成立后，九三学社在北京设址。由中央大学更名的南京大学设立九三学社小组。
“一·二五”大游行
1946年1月10日，政治协商会议在重庆召开。同时国民党当局利用英国在九龙屏山修建飞机场和法国轮船“白尔丁号”侵犯中国主权之事，转移人民对政治协商会议的关注视线。中央大学师生对英、法侵略行径十分气愤，纷纷要求举行示威游行。1946年1月25日清晨，中央大学全体同学（柏溪分校徒步60里）从沙坪坝出发，赶到市区牛角沱和其他学校同学汇合，游行队伍向上清寺国民政府所在地进发。吴有训校长和马寅初（时任中央大学兼职教授）、金善宝、楼光来、李旭旦、蒋孟引、张贵永等百余名教授也加入同学们的队伍。孙科、周恩来、陈启天、张君劢、莫德惠、邵力子等向游行群众讲了话，表示同意和接受学生的要求。
“一·二五”大游行，是抗战以来陪都重庆发生的规模最大的一次群众性民主运动，是促进政治协商会议成功的运动，是民主力量和反动力量的一次公开较量。
“五二〇”运动
“五二〇”运动是指1947年5月，由中央大学始发而后扩展到京沪苏杭平津等全国60多个大中城市的反饥饿、反内战、反迫害的青年学生爱国民主运动。
1946年6月，国民党发动全面内战。1947年5月6日，中央大学教授会召集全校教授大会，通过《要求提高教育经费，改善教员待遇宣言》，郑重作出五项决议，并表示“如不能达到目的，吾人为国家前途及实际生活计，当采取适当步骤，以求五项决议案之有效贯彻”之决心。《宣言》要求全国从事文化教育的工作者，一齐起来，坚决支持此决议案，这呼声震动了南北方各大学，也引发了学校的“吃光运动”。5月13、14日全校罢课。5月15日上午8时，中央大学、剧专等校学生集体请愿队伍出发。
中央大学学生要求增加副食费集体请愿的消息传开，杭州、上海、苏州、南昌等地的高校及清华、北大、南开等校也相继响应。
1947年5月20日上午，沪、苏、杭代表和中央大学本部学生游行队伍冲出包围，一路高呼“反饥饿、反内战、反暴行”口号，向总统府挺进。队伍到达珠江路路口时，遭到军警殴打，引发珠江路血案。（事后统计：珠江路血案重伤19人，轻伤104人，被捕28人，被殴打侮辱者不计其数。）
当晚，中央大学教授会、助教会和北京大学、清华大学教授发表声明，抗议政府的暴行；全国各地和社会各界，包括华侨和港澳同胞、国际学联、美国青年大会都发来声援、慰问函电。柳亚子、郭沫若、茅盾、叶圣陶、章伯钧、马寅初、翦伯赞等社会名流发表讲话，支持学生的正义行动；上海各大学成立“五二〇惨案后援会”；全国60多个城市的学生都纷纷游行罢课，展开了一场声势浩大的反饥饿、反内战、反迫害运动。
1954年6月16日，南京大学校务委员会作出两项决议，一项是“确定南京大学历史自三江师范学堂创办时（1902年）开始”；另一项便是“确定‘五二〇’为校庆日”，以纪念伟大的五二〇运动。 （图册：南京大学校史资料选辑 ）
护校斗争
1949年初，随着三大战役的胜利，南京、上海、武汉等国民党统治中心岌岌可危。此时行政院下达“国立院校应变计划”，要求各院校提出应变措施，选定迁校地址，呈教育部备案。1949年1月21日，中央大学校务会议讨论迁校问题，大多数教授反对，并通过了“以不迁校为原则”的决议，同时成立由校长，教务、训导、总务三长，各院院长、系主任以及各院教职员、学生代表等21人组成的应变委员会。南迁方案不成，周鸿经与训导长沙学俊、总务长戈定邦弃职而逃。
随后，中大地下党组织发动师生抗争，进行了非常激烈的护校斗争，据南京大学地球科学系教授王德滋回忆：“很多仪器已经装箱了，教授们坐在箱子上，不准抬走”。1949年1月31日，中央大学教授会投票选举产生“中央大学校务维持会”共11名委员，推选梁希、郑集、胡小石为常务委员，主持校政。
1949年2月7日，中央大学如期开学。“如果没那次护校斗争，也许就没有今天的南京大学。”王德滋说。
