太康五年闰十二月（285年初），杜预被征调到中央政府任司隶校尉，途中行至邓县，突然病故，终年六十三岁，司马炎甚为哀悼，追赠征南大将军、开府仪同三司，谥成侯 。
个人著作
杜预所撰写的《春秋左氏经传集解》三十卷，是《左传》注解流传至今最早的一种，收入《十三经注疏》中。据《隋书·经籍志》记载，杜预的书保留到唐世，还有《春秋左氏传音》三卷，《春秋左氏传评》二卷，《春秋释例》十五卷，《律本》二十卷，《杂律》七卷，《丧服要集》二卷，《女记》十卷以及他的文集十八卷。另有《春秋长历》等。
其中《集解》对后世《左传》研究颇有影响，至今仍有重要的学术价值。
杜预曾撰《善文》50卷，是中国古代较早的一个散文选本。
杜预还曾经和贾充一起定律令，曾作《二元乾度历》、《晋书·食货志》载其《陈农要疏》等多篇，表现了他多方面的才能。
历史评价
南土歌之曰：后世无叛由杜翁，孰识智名与功勇。
房玄龄：①预在内七年，损益万机，不可胜数，朝野称美，号曰“杜武库”，言其无所不有也。 ②杜预不有生知，用之则习，振长策而攻取，兼儒风而转战。孔门称四，则仰止其三；《春秋》有五，而独擅其一，不其优欤！夫三年之丧，云无贵贱。轻纤夺于在位，可以兴嗟；既葬释于储君，何其斯酷。徇以苟合，不求其正，以当代之元良，为诸侯之庶子，檀弓习于变礼者也，杜预其有焉。 ③昔之誓旅，怀经罕素。元凯文场，称为武库。
庾信：昔桓君山之志事，杜元凯之生平，并有著书，咸能自序。
姚思廉：昔邓禹基于文学，杜预出自儒雅，卒致军功，名著前代。
刘仁轨：内有武帝、张华，外有羊祜、杜预，筹谋策画，经纬谘询。
张说：猗欤杜侯，发挥孔圣。《春秋》既立，王道以正。列国行事，君子莫之。他人有心，予忖度之。推凡见例，定罪原词。开我後学，从祀先师。
杜甫：降及武库，应乎虬精。恭闻渊深，罕得窥测，勇功是立，智名克彰。缮甲江陵，祲清东吴。邦于南土，建侯于荆。河水活活，选舟为梁。洪涛奔汜，未始腾毒。《春秋》主解，稿隶躬亲。
李恒：在昔有晋，厥功平吴，惟茂先决策于中，惟元凯整旅于外。
杜牧：周有齐太公，秦有王翦，两汉有韩信、赵充国、耿恭、虞诩、段颎，魏有司马懿，吴有周瑜，蜀有诸葛武侯，晋有羊祜、杜公元凯，梁有韦睿，元魏有崔浩，周有韦孝宽，隋有杨素，国朝有李靖、李勣、裴行俭、郭元振。如此人者，当此一时，其所出计画，皆考古校今，奇秘长远，策先定于内，功后成于外。
崔致远：仲尼儒术，始流芳于沂水之湄；元凯战功，方挂美于岘山之顶。
李廌：书生昧筹算，罕立横草功。征南日耽经，帷幄明指踪。胸中有武库，矧与竖儒同。贤哉秉节度，不制蜀阿童。沈碑虽好名，要是真英雄。寥寥万山路，爽气摇松风。
程颐：常爱杜元凯语，若江海之波，膏泽之润，焕然冰释，怡然理顺，然后为得也。
张镃：征南勋业手，顾乃玩简策。麟经日月垂，左氏实有力。为渠作忠臣，训义订今昔。后来疑掖子，开卷随有益。果能作蹄筌，此学不妨痴。
郝经：杜预学识远到，志力刚明，有古儒将之风，而德度弗逮祜也。
陈元靓：慱斈多通，昔称传癖。释例既详，异论斯一。逮我庆成，布昭纯锡。追宠公台，增芳疏秩。
陈普：长历春秋两高阁，东南填淤正肥民。
陈子龙：自汉以后，文武渐分，然犹有虞诩、诸葛亮、周瑜、陆逊、司马懿、羊祜、杜预、温峤、谢玄、韦睿、崔浩、李靖、裴行俭、郭元振、裴度、李德裕、韩琦、李纲、虞允文之徒奋策儒素建功阃外，为时宗臣。彼岂必有抟虎之力，射雕之技哉？不过深明古今之事，能决机宜之便耳。
王夫之：杜预之于学也亦博矣，以其博文其不仁，六经之旨，且以之乱。谅闇者，梁菴也，有梁无柱，茅芐垂地之庐也，而诬之曰心丧。叔向之讥景王曰：“有三年之丧二。”谓之有丧矣，非谓存诸内者之徒戚也，而诬之曰不讥除丧，而讥其燕乐之已早。预之存诸内者，诬圣欺天，绝人而禽之，犹曰君子之于礼，存诸内而已乎？故曰：“以礼制心。”心有不存，而礼制之。其外无别，则内之存与不存，又奚以辨哉？邪说逞，人道息。凡今之人，皆曰：臣忠、子孝、兄友、弟恭，求其心而已。而心之不可问者多矣。不仁哉杜预之言，以贼天下有余也！
屈大均：汉唐以来善兵者率多书生，若张良、赵充国、邓禹、马援、诸葛孔明、周瑜、鲁肃、杜预、李靖、虞允文之流，莫不沉酣六经，翩翩文雅，其出奇制胜如风雨之飘忽，如鬼神之变怪。
李慈铭：若羊祜之厚重，杜预之练习，刘毅之劲直，王濬之武锐，刘弘之识量，江统之志操，周处之忠挺，周访之勇果，卞壸之风检，陶侃之干局，温峤之智节，祖逖之伉慨，郭璞之博奥，贺循之儒素，刘超之贞烈，蔡谟之检正，谢安之器度，王坦之之风格，孔愉之清正，王羲之之高简，皆庸中佼佼，足称晋世第一流者，盖二十人尽之矣。
逸闻趣事
《艺文类聚》及《太平广记》载有一事，指杜预为荆州刺史，镇守襄阳时，曾在居所内大醉独呕，被一小吏看到其化身为一条大蛇。
后世地位
公元647年（贞观二十一年），唐太宗诏令历代先贤先儒二十二人配享孔子，其中就包括杜预。
公元782年（建中三年），礼仪使颜真卿向唐德宗建议，追封古代名将六十四人，并为他们设庙享奠，当中包括“晋镇南大将军当阳侯杜预”。 及至公元1123年（宣和五年），宋室依照唐代惯例，为古代名将设庙，七十二位名将中亦包括杜预。 在北宋年间成书的《十七史百将传》中，杜预亦位列其中。
杜预是明朝之前唯一一个同时进入文庙和武庙的历史人物。
