1933年1月27日，陈济棠、白崇禧、蔡廷锴会商决定“抗日、剿共同时并进”。11月20日国民革命军第十九路军在福建发动“闽变”，成立“中华共和国”，22日白崇禧列名通电，责李济深、陈铭枢等“背叛主义，招致外寇，煽动赤祸，尽丧所守”，劝“幡然改图”。1934年6月21日白崇禧自广西抵广州，商赣南“剿匪”事，22日何键、陈济棠、白崇禧、蒋伯诚、薛岳在广州举行剿匪军事会议。7月14日白崇禧、黄绍竑访胡汉民于香港，15日白回广州。8月18日白崇禧赴赣南南安视察部队，9月7日离广州回桂。10月15日中央红军离开江西根据地实行长征，11月17日白崇禧赴湘桂边布置防务，在全州召开会议，确定了“对红军只宜侧击、追击，不宜堵击”的作战思想，18日红军前队攻龙虎关，22日红军一部经龙虎关入广西贺县白芒营，桂军和湘军联合追击堵截，26日红军全队进至道河以西湘桂交界，经永安关、龙虎关、清水关、雷口关入广西文市等地，桂军集中恭城、富川、贺县，防红军南进，时白崇禧在平乐指挥，但红军意图并非入桂，28日红军主力乘机西渡漓江，过广西兴安全州间之界牌西北趋，另支与桂军夏威部战于文市，占领新圩，蒋介石电责白崇禧任匪西渡，29日“追剿军”及桂军败红军后队于永安关、灌阳间，克新圩，红军强渡湘江，12月1日白崇禧电蒋介石等，有所申辩，并指“追剿军（何键）”瞻望不前，6日红军第一、第三、第五、第八、第九军团分三路自龙胜趋湘边，桂军由夏威、廖磊指挥追击，20日广西军组两纵队入黔追击，以夏威、廖磊任司令。
1936年1月28日，贵州省府主席吴忠信自南京到南宁，晤白崇禧，劝与中央合作。2月24日，日本松井石根大将自广州飞广西南宁，访白崇禧，25日返粤。3月16日，铁路部长张嘉璈到南宁，与白崇禧等商湘桂铁路建筑计划。5月14日，白崇禧、黄旭初到广州商时局，15日陈济棠就两广共同反蒋问题与白崇禧密商，达成协议，20日李宗仁亦到广州，22日居正、孙科等与陈济棠、白崇禧等会商时局，30日白崇禧自广州回南宁，密令各军动员入湘。6月1日，白崇禧联合广东陈济棠发动“两广事变”，4日电请中央准予出兵北上抗日。18日陈济棠因广东内部分化而下野，“两广事变”失败，22日白崇禧电冯玉祥，愿听命中央，25日国民政府调任白崇禧为浙江省政府主席，27日白崇禧不从，29日召开军事会议，征调民团，31日桂军分路进向广东封川、信宜。8月5日桂军增防梧州，禁止船只开行，9月2日程潜、朱培德、居正携蒋介石亲笔函到南宁，终于使白放弃反蒋，6日特任白崇禧为军事委员会常务委员，两广事变终于和平解决，蒋介石邀白崇禧来粤，李宗仁自知广西大营交与内政能力更强的白崇禧效果更好，即毅然飞赴广州，充当人质。
抗日战争
1937年7月7日抗日战争爆发，7月21日白崇禧、李宗仁、黄旭初联名致电国民政府，拥护蒋介石对日抗 战，26日蒋介石派刘斐赴广西，促白崇禧入京参赞中枢。8月2日蒋介石致电白崇禧，约他们赴南京共商抗日大计。8月4日，蒋介石派飞机将白从桂林接到南京，20日任军事委员会参谋本部副参谋总长兼军训部部长，主持制定抗战计划，提出对了日军作战的六条指导原则。
1938年1月1日军事委员会改组，白崇禧任军训部长，掌理陆海军训练整理、军事学校建设改进。3月24日，白崇禧随蒋介石至徐州视察，并留在徐州协助李宗仁指挥台儿庄会战，经常到战地与各军、师的高级将领联络，代表武汉大本营面致慰问，鼓舞士气。4月6日至8日，国民党召开五届四中全会，白崇禧增选为中央政治委员会委员。5月15日自徐州城内移往南门外段家花园，16日撤离徐州。5月，“中国回教救国协会”在武汉成立，白崇禧任理事长。7月17日特任第五战区代理司令长官（李宗仁因病住院）。7月19日，白崇禧得知日军第六师团沿长江北岸向西进犯武汉地区，立即部署第五战区李品仙兵团12个师围歼这一路孤军，经大小战役数十次，击破日军于田家峪要塞。9月军训部由武汉迁祁阳，12月迁桂林虞山庙。10月16日敌陷广东博罗，白崇禧自武汉赴广州指挥，21日敌陷广州。11月30日蒋介石令白崇禧兼任桂林行营主任，负责第三、四、七、九战区的作战，管理半壁江山。白崇禧兼任第四战区司令长官，在武汉军事会议中，白崇禧建言提出“坚壁清野”、“焦土抗战”、“发展游击战、配合正规战”、“积小胜为大胜，以空间换取时间”等，这些建议,为军事委员会最高领袖蒋介石所采纳,遂成为抗日最高战略指导方针,对抗战全盘策略影响至深、至广。
1941年冬，白崇禧编写了《游击战纲要》一书。1943年5月，重庆成立中国宗教徒联谊会，白崇禧为常务理事之一。7月蒋介石派白崇禧到兰州，办理甘肃回民暴动善后事宜。9月出席国民党五届十一中全会。
1944年1月1日，以抗日期间着有功绩，国民政府授白崇禧青天白日勋章以资嘉奖。5月日寇沿粤线南犯，长衡会战爆发，蒋介石原要白崇禧前往四、九两战区指挥作战，白以蒋不听从他的在桂柳决战的主张，仅允传达统帅意旨，而不愿担任指挥任务。6月22日白崇禧从重庆飞桂林，先与第四战区司令长官张发奎会商，25日白崇禧、张发奎召开第四战区高级将领会议，制定初期作战计划，成立桂林市城防司令部，派第十六集团军副总司令韦云淞为桂林防守司令。7月14日，去湖南晤第九战区薛岳，建议该战区主力应部署在湘桂铁路两侧，使日敌不敢沿湘桂路直驱直入而攻桂林，薛不允许。9月，蒋介石派白崇禧以副参谋总长的名义前往第四战区指挥桂柳会战。10月30日，白崇禧从柳州飞返重庆，向蒋介石报告湘桂战况，仍要求第九战区主力，应集中湘桂沿线作战，薛岳虽将杨森兵团、李玉堂兵团调入广西，但为时过迟，与第十六集团军未能紧密配合，终于出现湘桂大撤退，一泻千里的局面。11月10日柳州陷落，11日桂林失陷，桂柳会战以中国军队的失败而告结束。11月兼“海军整建委员会”委员。
解放战争
1945年5月5日国民党在重庆召开六大，白崇禧在大会上做军事报告，19日当选为国民党第六届中央委
员，31日被选为中央执行委员会常务委员。8月后著有《现代陆军军事教育之趋势》。10月3日，国民政府令“陆军二级上将白崇禧晋任为陆军一级上将”。10月10日授予抗战胜利勋章。11月11日白崇禧参加复原整军会议，会前期期以为不可裁军，13日在整军会议宣布裁撤各军官分授及各班团。1946年1月4日白崇禧自重庆到南京，7日何应钦自南京飞重庆，白崇禧代理陆军总司令职。3月1日被选为国民党第六届中央执行委员第二次全体会议主席团成员，17日选为中央常务委员。
1946年5月16日白崇禧到北平，17日飞沈阳督战，与杜聿明商讨东北作战问题并且参与指挥，杜聿明、孙立人、廖耀湘等将领一举击溃林彪。
1946年5月15日，国防最高委员会决议，任白崇禧为国防部长，23日下特任令。6月1日国防部在南京黄埔路中央军校旧址正式成立，白崇禧任第一任部长。10月3日国民政府派白崇禧为绥靖区政务委员会主任委员，11月成立国防科学委员会，白崇禧兼主任委员。
1947年1月30日成立行政院绥靖区政务委员会督察团，白崇禧为团长，2月13日白崇禧抵南通，召开绥靖区会议，26日到北平出席冀热区绥靖会议。3月3日白崇禧到张家口，4日到绥远，6日到太原，7日返回南京。2月28日台湾爆发“二二八事变”，3月9日白崇禧奉派准备赴台湾，11日国民政府派白崇禧前往台湾宣慰，对于此次纷扰事件权宜处理，白崇禧对旅沪台人代表陈碧笙等申述处理台变方针（改革政制，取消专卖制度，台省省内省外人一律平等，派兵为国防上之需要，非为镇压人民）。3月17日白崇禧及蒋经国自南京到台北，即发表文告，宣布处理台湾事变四原则，18日访台湾参议会，并招待台北各界人士，22日到台南，23日到台中，25日经新竹回抵台北，26日在台北广播劝高山族检举现场逃逸之“暴徒”。4月1日白崇禧发表处理台湾善后五项办法，2日自台湾返抵南京，7日报告台湾事变善后，主改革政治经济制度，调整人事。4月23日特任张群内阁政务委员兼国防部长。5月1日，白崇禧在立法院报告军事，决”先完成统一”。6月12日王世杰、白崇禧出席立法院，说明北塔山事件。11月7日，蒋以虞电命令成立国防部九江指挥所，派白崇禧部长坐镇九江，进行统一指挥五省辖区作战，并指导豫皖赣湘鄂五省省政府和该省之保安部队，其任务是“彻底勘平津浦路以西，长江以北，平汉路以东，淮河以南大别山区匪乱，巩固治安”。随后白崇禧在确山战役中化解陈赓和粟裕的两面夹击，力保整20师不失。11月10日蒋介石召见白崇禧，要他在九江设立国防部长指挥所，动员中原五省兵力，对刘邓大军采取防堵阻击措施，这是国共大战以来，蒋介石第一次授予白崇禧以指挥权，他主张机动作战，但他的300架运输机在全国五大战略区机动和集中10个整编旅骑兵的计划不为蒋所接受，17日“国防部长九江指挥所”宣告成立，主要力量是第五绥区和第八绥区部队和张淦第三兵团、张镇首都卫戍司令部、直辖部队等，约二十余万人。11月24日白崇禧到蚌埠布置军事，27日白崇禧到九江，主持华中战事，曾提出“总体战”口号，呼吁“全民动员，同灭共党”。12月4日白崇禧自九江抵汉口，指挥大别山区战事，对抗大别山的刘邓大军，5日自汉口到信阳布置军事。12月7日白崇禧在汉口谈清剿计划，“加强地方自卫武力，军事与政治经济严密配合”，12日白崇禧之指挥部自九江移汉口，19日自汉口到长沙视察。…
